Entité de rattachement
UMR 7206
Thème interdisciplinaire de recherche
Génétique des population humaine, Génétique des populations de primate
Spécialité
Génétique

Contact

Courriel
lafosse [at] mnhn.fr

Responsabilités dans l'unité

  • Assistante de Prévention UMR7206 
  • Responsable Hygiène et Sécurité de P2GM 
  • Référente autorisation OGM pour P2GM 
  • Responsable de la formation des nouveaux entrants à l’environnement de laboratoire 
  • Responsable de la Banque de primers anciens et modernes

Présentation

Activités de Recherche

Génétique des population humaine :

  • Adaptation à l’alimentation des populations d’Asie Centrale.
  • Influence des facteurs culturels sur la diversité génétique de populations d’Asie du Sud-Est. Cambodge et Laos.
  • Influence de l’alimentation et de l’accès aux soins sur la diversité du microbiome intestinal chez les populations Beti du Cameroun 

Génétique des populations de primate :

  • Diagnostique parasitaire sur des populations de chimpanzés et Bonobos sauvages en Ouganda et en RDC.
  • Etude de la diversité génétique de l’ADN mitochondrial dans des populations de cercopithèques de Madagascar.
  • Étude de la structure génétique de quatre populations de gorilles des plaines de l'ouest (RCA et RC)
  • Étude de parenté (ADN génomique et mitochondrial) sur des populations sauvage de chimpanzés du parc National de Kibale en Ouganda.

 

Missions Annexes et Actions Transversales

  • ACMO/AP - SST 
  • Référente OGM 
  • Membre élu du conseil de l’UMR 
  • Jury de concours de sélection professionnelle, jury de thèse vétérinaire 
  • Agencement des nouveaux laboratoires du Musée de l’Homme après rénovation 2012-215 
  • Organisation en octobre 2018 du 31ème colloque de la SFDP à Paris

 

Encadrement Technique et Scientifique

Stage BTS, Master 1, Master2, de césure M1/M2

  • 2010 M2 : Marie Cibot “Resiliency of wild chimpanzees to anthropic pressures in Sebitoli area, Kibale National Park, Uganda
  • 2010 M2 : Thierry Sugitani "Etude du polymorphisme du gène MCR1 dans six populations d’Asie Centrale"
  • 2010 M1 : Sophie Rostaing « Impact de la perturbation de l’habitat sur les migrations inter-communautés des chimpanzés. Parc National de Kibale, Ouganda »
  • 2011 M2 : Agnès Sjöstrand “The ADH Polymorphismin nomadic (Kyrgyz) and agriculturalist (Tajik) populations of Central Asia
  • 2014 M2 : Gabriele-Maria Sgarlata “Propithecus Coronatus : speciation and conservation perspective according to the inter and intra-specific genetic variability of the mitochondrial HV1 region"
  • 2015 césure M1/M2 : Emma Dikongué “Microbial characterization of the gut of diverse human populations from Cameroon
  • 2016 BTS : Anouk Laurent "Etude de la parenté des babouins par génotypage de microsatellites sur chromosomes autosomaux"
  • 2017 M2 : Julie Baer "Contribution de l’étude génétique à la compréhension des causes de dysplasie faciale dans la communauté de chimpanzés de Sebitoli, Parc National de Kibale,Ouganda"
  • 2018 césure M1/M2 : Chloé Chabaud "Etude d’apparentement génétique chez les gorilles de plaine de l’ouest
  • 2018 M1 : Sophie Aflalo "Diversité microbienne intestinale et salivaire en milieu rural et urbain au Cameroun"

Thèses

  • 2001 : Laurence Hameau "Etude in vitro de la terminaison de la retro-transcription du VIH-1."
  • 2002 : Sébastien Lyonnais "VIH-1, ADN, Flap central, quartets de guanine. Assemblage et remodelage in vitro."
  • 2006 : Fabrice Landousy "Développements méthodologiques et caractérisation des complexes ADN-protéines par AFM."
  • 2007 : Pauline Dupaigne "Etude des mécanismes impliqués dans la régulation de la recombinaison homologue."
  • 2010 : Laure Ségurel "Mode de vie et diversité génétique dans les populations humaines d’Asie Centrale."
  • 2012 : Marie Cibot "Interactions humains - chimpanzés sauvages et conséquences sanitaires : Étude préliminaire à Sebitoli, Parc national de Kibale, Ouganda."
  • 2014 : Victor Narat "Interactions bonobos-habitats-humains : habituation, écologie, santé et conservation."
  • 2017 : Julie Baer "Contribution de l’étude génétique à la compréhension des causes de dysplasie faciale dans la communauté de chimpanzés de Sebitoli, PN de Kibale, Ouganda". Thèse vétérinaire
  • 2017 : Goki Ly "Du système de parenté à la diversité génétique dans les populations humaines d’Asie du Sud-Est"
  • 2018 : Bérénice Alard "Histoire démographique et adaptative des Austro-Asiatiques : une approche génomique"

Publications

2021
  • Groussin Mathieu, Poyet Mathilde, Sistiaga Ainara, Kearney Sean, Moniz Katya, Noel Mary, Hooker Jeff, Gibbons Sean, Segurel Laure, Froment Alain, Mohamed Rihlat Said, Fezeu Alain, Juimo Vanessa, Lafosse Sophie, Tabe Francis et al., avril 2021Elevated Rates of Horizontal Gene Transfer in The Industrialized Human Microbiome. Cell vol. 184, n° 8, 2053-2067.e18
2020
  • SÉGUREL Laure, GUARINO-VIGNON Perle, MARCHI Nina, LAFOSSE Sophie, LAURENT Romain, BON Céline, Fabre Alexandre, Hegay Tatyana & HEYER Evelyne, juin 2020Why and when was lactase persistence selected for? Insights from Central Asian herders and ancient DNA. PLoS Biology vol. 18, n° 6, e3000742
  • Lokmer Ana, Aflalo Sophie, Amougou Norbert N., Lafosse Sophie, Froment Alain, Ekwin Tabe Francis, Poyet Mathilde, Groussin Mathieu, Said-Mohamed Rihlat & Ségurel Laure, février 2020Response of the human gut and saliva microbiome to urbanization in cameroon. Scientific Reports vol. 10, n° 1, dir. {Nature Publishing Group}
  • CHAIX Raphaëlle, LY Goki, LAURENT Romain, LAFOSSE Sophie, TOUPANCE Bruno, Monidarin C., Evrard O., Bourdier F. and PAVARD Samuel, 2020Structures sociales et structures génétiques dans les populations humaines. BMSAP vol. 31, 1-2, p. 18-23
2019
  • LY Goki, LAURENT Romain, LAFOSSE Sophie, Monidarin Chou, Diffloth Gérard, Bourdier Frédéric, Evrard Olivier, TOUPANCE Bruno, PAVARD Samuel & CHAIX Raphaëlle, juillet 2019From Matrimonial Practices To Genetic Diversity in Southeast Asian Populations: The Signature Of The Matrilineal Puzzle. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences vol. 374, n° 1780, p. 20180434
  • LY Goki, LAURENT Romain, LAFOSSE Sophie, Monidarin C., Diffloth G., Bourdier F., Evrard O., TOUPANCE Bruno, PAVARD Samuel & CHAIX Raphaëlle, 2019From matrimonial practices to genetic diversity in Southeast Asian populations: the signature of the matrilineal puzzle. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci vol. 374, n° 1780, p. 20180434
2018
  • MARCHI Nina, MENNECIER Philippe, Georges Myriam, LAFOSSE Sophie, Hegay Tatyana, Dorzhu Choduraa, CHICHLO Boris, SÉGUREL Laure, HEYER Evelyne, 2018Close Inbreeding and Low Genetic Diversity in Inner Asian Human Populations Despite Geographical Exogamy. Scientific Reports vol. 8, n° 1, p. 9397
    ISSN
    2045-2322
  • LY Goki, ALARD Bérénice, LAURENT Romain, LAFOSSE Sophie, TOUPANCE Bruno, Monidarin C., Diffloth G., Bourdier F., Evrard O., PAVARD Samuel & CHAIX Raphaëlle, 2018Residence rule flexibility and descent groups dynamics shape uniparental genetic diversities in South East Asia. Am J Phys Anthropol vol. 165, n° 3, p. 480-491
2016
  • Sgarlata G.M., Salmona J., Razanaparany T.P., Rabarivola C.J., Jan F., Rasolondraibe E., Andriaholinirina N.V., LAFOSSE Sophie, Chikhi L., MANNI Franz, BAYART Françoise, 2016Mitochondrial Genetic Diversity in the Crowned Sifaka (Propithecus Coronatus) in a Fragmented Landscape. Primate Conservation , n° 30, p. 39-57
2015
  • Morton Elise R, Lynch Joshua, FROMENT Alain, LAFOSSE Sophie, HEYER Evelyne, Przeworski Molly, Blekhman Ran and SÉGUREL Laure, 2015Variation in Rural African Gut Microbiota is Strongly Correlated with Colonization by Entamoeba and Subsistence. PLoS genetics vol. 11, n° 11,